Montagem de Genoma
O IPR disponibiliza serviços de Montagem de Genomas com pipelines de bioinformática consolidados.
O sequenciamento genômico é uma ferramenta essencial na biologia moderna, permitindo novas descobertas sobre a composição genética dos organismos. Com esta tecnologia, podemos determinar a sequência completa de DNA de diversos organismos, incluindo aqueles de ambientes extremos, sendo indispensável na pesquisa de engenharia genética para aplicações biotecnológicas.
Existem dois métodos principais para a montagem de genomas: montagem baseada em referência e montagem de novo. A montagem baseada em referência utiliza um genoma conhecido e anotado como modelo para organizar o novo genoma sequenciado.
Por outro lado, a montagem de novo não depende de um genoma de referência e reconstrói a sequência completa do genoma a partir da sobreposição de fragmentos sequenciados. Este método tem várias vantagens, como a descoberta de novas variantes estruturais e a redução do viés dos genomas de referência. No entanto, a montagem de novo apresenta desafios significativos, especialmente ao trabalhar com reads de pequeno tamanho das plataformas de NGS.
Serviços disponíveis:
- Análise de qualidade das reads
- Mapeamento ou montagem de novo
- Predição de genes e anotação funcional
- Análise comparativa