Análises de Dados de RNA-seq

O IPR disponibiliza serviços de Análises de Dados de RNA-seq com pipelines de bioinformática consolidados para qualquer organismo, que tenham ou não genoma de referência.

RNA-seq é uma técnica que quantifica e analisa os níveis de expressão gênica em amostras biológicas. Ao contrário do sequenciamento genômico, que determina a sequência completa de DNA de um organismo, o RNA-seq identifica e quantifica os diferentes tipos de RNA em uma célula ou tecido em um momento específico.

Após o sequenciamento, os dados são processados com ferramentas de bioinformática.

Serviços disponíveis:

• Análise de qualidade das reads
• Mapeamento ou montagem de novo
• Quantificação de expressão gênica
• Análise estatística

Aplicações

Quantificação de expressão gênica

Identificação de novos transcritos e isoformas

Perfil de expressão de pequenos RNAs

Detecção de RNAs não-codificantes longos (lncRNAs)

Análise de fusão gênica e mutação de RNA

Análise de redes reguladoras gênicas

Genômica comparativa