Usuários e instituições envolvidas direta ou indiretamente com o Pró-Mata devem ter uma participação consciente e responsável, observando a necessidade de compatibilizar o uso da área com a proteção ambiental. É necessário, portanto, o compromisso de cada usuário em tomar conhecimento e seguir com atenção as advertências e recomendações com relação às suas regras e normas específicas. No Manual do Usuário destacam-se algumas recomendações que devem ser observadas visando à co-responsabilidade com a conservação da natureza e a infra-estrutura do Pró-Mata.